南區國稅局表示，依營業人開立銷售憑證時限表規定，包作業應於工程合約所載每期應收價款時開立統一發票，縱使工程款未收訖，仍不影響其應依法開立統一發票之作為義務。

該局說明，轄內甲公司承攬政府公共工程，其中工程尾款，未依營業人開立銷售憑證時限表規定之時限，開立統一發票交付政府機構及報繳營業稅，經國稅局查獲，除補徵營業稅額外，並按所漏稅額裁處罰鍰。甲公司不服，主張系爭工程尾款因遭法院扣押，致其無從請求給付，且經結算結果，扣除違約賠償費用後，尚有不足，故其得請領之工程尾款為零，自無開立發票之義務等由，循序提起行政救濟，經高等行政法院判決甲公司敗訴。

高等行政法院判決理由指出，查營業人因法院針對工程款核發扣押命令，致無從請求給付，尚無統一發票使用辦法第4條得免用或免開統一發票規定之適用。又依「營業人開立銷售憑證時限表」規定，甲公司應依工程合約所載每期應收價款時開立統一發票，並依規定申報銷售額及繳納應納稅額，上述開立統一發票之法定義務與其開立後是否確能請領工程款無涉。再者，出包人依工程合約對承包人請求之違約賠償款項，亦與承包人應依限開立發票係屬二事，故縱如甲公司所稱工程結算結果， 系爭工程尾款扣除違約賠償費用後，尚有不足，亦不得因此而免除開立發票之義務，乃判決甲公司敗訴。

該局提醒，承包土木建築工程之營業人，應注意按工程合約記載每期應收價款時開立統一發票交付買受人，以免被查獲後遭受補稅及處罰。