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所得憑單申報資料錯誤申請更正時，除應向所轄稽徵機關提出申請外，依錯誤情況分別應檢附相關資料：
一、更正如不涉及金額變更，原申報書金額無誤，例如：所得人身分證統一編號、姓名、地址填寫錯誤者，需檢附：
（1）所得人身分證影本等相關證明文件。
（2）更正前、後各類所得扣繳暨免扣繳憑單、股利憑單或信託財產各類所得憑單。
（3）原申報各類所得扣繳暨免扣繳憑單申報書、股利憑單申報書或信託財產各類所得憑單申報書影本。
二、更正如涉及原申報書金額、所得類別更正或所得分割成兩個或以上不同人者，需檢附：
（1）帳簿及正確金額之證明資料，如薪資印領清冊、租賃契約書或收據費用帳等相關憑據資料。
（2）更正前、後各類所得扣繳暨免扣繳憑單申報書、股利憑單申報書或信託財產各類所得憑單申報書。
（3）更正前、後各類所得扣繳暨免扣繳憑單、股利憑單或信託財產各類所得憑單。（4）涉及扣繳稅額之更正另附該扣繳稅款繳款書。
扣繳單位若採電子（媒體或網路）申報則尚需注意：
一、採媒體申報之扣繳單位申請更正時，原則以人工方式並檢附前揭相關資料辦理更正；惟於稽徵機關媒體申報資料收檔前，准予辦理媒體更正，但退查或更正筆數多者，須於98年3月10日前辦妥媒體更正，原申報媒體磁片或光碟片不予抽換，且為保留原申報檔案資料完整性，錯誤磁片不予退還。
二、採網路申報之扣繳單位申請更正時，請檢具網路申報回執聯及申請更正各項資料所需文件，由所屬稽徵機關受理收件並審查有無違章情形，再由申報單位選擇採用下列2種方式之一辦理更正：
（1）申報單位如欲註銷所有網路申報資料，改採媒體申報，尚須檢具媒體檔案遞送單、完整正確資料檔案（磁片或光碟片）及各類所得扣(免)繳憑單申報書或股利憑單申報書全份，由所轄國稅局註銷申報單位所有網路申報資料，並依媒體申報程序，辦理後續作業。
（2）申報單位如欲註銷網路申報資料錯誤部分，改採人工申報，尚須檢具人工申報專用扣(免)繳憑單或股利憑單報核聯及各類所得扣(免)繳憑單申報書或股利憑單申報書全份，由所轄國稅局註銷網路申報資料錯誤部分，並依人工申報程序，辦理後續作業。
財政部高雄市國稅局表示：98年度各類所得資料扣(免)繳憑單及股利憑單申報已於2月1日截止，近來常有扣繳單位來電詢問，已經辦理各類所得扣（免）繳憑單申報，現在發現申報錯誤要如何申請更正？
該局就不同錯誤型態，分別將其更正方式說明如下：
（一）扣繳憑單之納稅義務人國民身分證統一編號填寫錯誤，應填寫申請書並檢附：
1.納稅義務人國民身分證影本
2.原填報扣（免）繳憑單第3聯（存根聯）
3.更正後扣（免）繳憑單第1聯（報核聯）
（二）給付總額、稅額錯誤，應填寫申請書並檢附：
1.帳簿
2.薪資印領清冊（或收據）
3.更正前原扣（免）繳憑單第3聯（存根聯）
4.更正後扣（免）繳憑單第1聯（報核聯）
5.原申報「各類所得扣繳暨免扣繳憑單申報書」第2聯
6.更正後「各類所得扣繳暨免扣繳憑單申報書」全份
7.各類所得扣繳暨免扣繳憑單申報書更正、註銷明細表
8.綜合所得稅各類所得資料更正、註銷明細表
三、涉及股利金額、可扣抵稅額及股利憑單份數等變動之更正時，應檢附：
（1）帳簿及正確金額之證明資料，如營利事業所得稅結算申報之資產負債表、股東可扣抵稅額帳戶帳簿、未分配盈餘申報表及股東（董監事）會議決議書（議事錄）等相關文件影本資料。
（2）原填報股利憑單存根聯。
（3）更正後股利憑單報核聯。
（4）綜合所得稅各類所得資料更正(註銷)明細表。
（5）原申報股利憑單申報書第2聯。
（6）更正後股利憑單申報書第1、2聯。
3-6 扣繳書表錯誤之申請更正或註銷